抖店关联店铺主体违规货款被冻结6个月的原因可能有以下几点：

1. 店铺违规行为：如果抖店存在违规行为，如虚假交易、抄袭侵权、出售违禁商品等，平台可能会采取处罚措施，冻结货款。

2. 店铺经营不善：如果店铺经营不善，存在连续缺货、违规等情况，也会导致货款被冻结。

3. 账户行为异常：如果账户存在异常行为，如大量刷.单、刷.粉等，平台可能会采取冻结货款措施，以保护消费者权益。

4. 未履行合同义务：如果商家与平台签订了合同，但未履行合同中规定的义务，如未按时发货、未提供约定的售后服务等，

平台可能会采取冻结货款措施。

货款被冻结的原因可能涉及多个方面，需要商家仔细排查自己的行为，积极采取措施，尽快解决相关问题，以避免更严重的后果。

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